大航海时代起源的地图系统以真实世界为蓝本，从北极圈的浮冰海岸到赤道的热带雨林，每个区域都呈现出独特的自然风貌。游戏中的洋流与季风系统直接影响航行效率，北大西洋的西风带能加速船只航行，而印度洋的季风则会随季节改变方向，玩家需要根据这些自然因素规划最佳航线。逆风或风暴区域会显著降低航行速度，甚至可能造成船只损坏。

北欧地区的地图设计极具特色，斯堪的纳维亚半岛的锯齿状海岸线和冬季浮冰给航行带来挑战。哥本哈根港是重要的贸易中心，主要交易鱼类、铁矿等特产。这里的造船厂擅长建造破冰船，非常适合在寒冷海域探险。玩家还能从当地村民那里获得隐藏银矿的线索，为航海之旅增添更多可能性。

西欧地图则展现了繁华的航海贸易景象，英吉利海峡上商船往来频繁。伦敦港停靠着武装商船，里斯本航海学校展示着最新海图。巴黎市场汇集了来自世界各地的商品，安特卫普的呢绒和波尔多的葡萄酒都是热门贸易品。完成王室委托的探索任务还能获得专属贸易特权，让玩家在商业竞争中占据优势。