游戏收录了超过百位忍者角色，从下忍到影级应有尽有。这些忍者按照稀有度分为SSS、SS、S三个等级，其中SSS级忍者实力最为强大。玩家可以通过限时招募活动获取限定忍者，达成指定抽取次数还能获得保底奖励。新手福利包括首充礼包和七日狂欢活动，可以直接获得大蛇丸、佐助等强力角色。此外，积分商店、据点探索和忍者商店也提供了稳定的碎片兑换渠道。

忍者培养系统非常丰富，包括等级提升、装备搭配和护佑共享等多个方面。等级提升需要消耗经验丹和铜币，达到一定等级后还需要使用进阶手札进行突破。装备系统会根据任务和副本产出不同品质的装备，高品质装备能带来更显著的战力提升。游戏还提供了一键穿戴功能，可以快速为忍者匹配最优装备。

战斗玩法以放置自动战斗为主，同时包含多种副本和挑战模式。主线冒险是游戏的核心内容，随着剧情推进可以解锁更多关卡。据点探索采用爬塔机制，每层都有特定的守关阵容，通关后可以获得SSS级忍者等珍贵奖励。加速修炼系统可以帮助玩家快速获取经验，VIP等级越高获得的经验加成也越多。